• Αλγοριθμικών Εφαρμογών και Λογικής – Διευθυντής :  Καθ. Συμβώνης Αντώνιος
• Στατιστικής – Διευθυντής :  Καθ. Φουσκάκης Δημήτριος
• Υπολογιστικών Μαθηματικών και Μαθηματικής Προτυποποίησης – Διευθυντής :  Καθ. Γεωργούλης Εμμανουήλ
• Οικονομικών Μαθηματικών και Μαθηματικής Βελτιστοποίησης – Διευθυντής :  Αναπ. Καθηγητής Παπαπαντολέων Αντώνιος
• Εργαστήριο Αλγεβρικών, Γεωμετρικών και Τοπολογικών Εφαρμογών – Διευθυντής : Καθηγητής Ψαρράκος Παναγιώτης
• Σπουδαστήριο Ανωτέρων Μαθηματικών – Διευθυντής :  Καθηγητής Λουλάκης Μιχαήλ (Διευθυντής Τομέα).