- Αλγοριθμικών Εφαρμογών και Λογικής – Διευθυντής : Καθ. Συμβώνης Αντώνιος
- Στατιστικής – Διευθυντής : Καθ. Φουσκάκης Δημήτριος
- Υπολογιστικών Μαθηματικών και Μαθηματικής Προτυποποίησης – Διευθυντής : Καθ. Χρυσαφίνος Κωνσταντίνος
- Οικονομικών Μαθηματικών και Μαθηματικής Βελτιστοποίησης – Διευθυντής : Αναπ. Καθηγητής Παπαπαντολέων Αντώνιος
- Εργαστήριο Αλγεβρικών, Γεωμετρικών και Τοπολογικών Εφαρμογών – Διευθυντής : Καθηγητής Ψαρράκος Παναγιώτης
- Σπουδαστήριο Ανωτέρων Μαθηματικών – Διευθυντής : Αν. Καθηγητής Λουλάκης Μιχαήλ (Διευθυντής Τομέα).